在自然界中存在多種嗜油菌株,如解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica),它們可以利用疏水性底物作為唯一碳源進(jìn)行生長(zhǎng)、代謝和繁殖。近年來(lái),隨著合成生物學(xué)的發(fā)展,解脂耶氏酵母已被廣泛用于降解含油食物垃圾、處理石油污染的土壤、發(fā)酵生產(chǎn)高價(jià)值的化學(xué)品。微生物包埋技術(shù)可為它們提供物理保護(hù),從而提高其穩(wěn)定性、重復(fù)利用性,以及增加它們?cè)谏锓磻?yīng)器中的密度。然而,當(dāng)前包埋微生物的材料均為親水性材料,無(wú)法發(fā)揮解酯耶氏酵母的獨(dú)特性質(zhì)。同時(shí),在混菌發(fā)酵體系中,利用親水材料包埋解酯耶氏酵母難以避免與其他菌株進(jìn)行底物競(jìng)爭(zhēng)。
近日,天津大學(xué)化工學(xué)院生物化工系張雷教授與制藥工程系肖文海副教授合作,首次開(kāi)發(fā)了生物相容性疏水有機(jī)膠材料用于高效包埋解酯耶氏酵母。利用疏水性的包埋材料可將解酯耶氏酵母停留在油相中利用油性碳源,避免與水相中的微生物競(jìng)爭(zhēng),可以實(shí)現(xiàn)碳源利用正交化,為合成生物學(xué)中新型混菌體系模型的研究提供了平臺(tái)。此外,作者利用有機(jī)膠材料包埋酵母,在不添加任何保護(hù)劑的條件下實(shí)現(xiàn)了酵母的長(zhǎng)期超低溫凍存。該工作以“Development of Organogels for Live Yarrowia lipolytica Encapsulation”為題發(fā)表于國(guó)際知名學(xué)術(shù)刊物《Journal of the American Chemical Society》。
此研究受到解酯耶氏酵母可攝取長(zhǎng)鏈烷烴作為碳源的啟發(fā),選用一系列化學(xué)結(jié)構(gòu)相似但具有不同側(cè)鏈長(zhǎng)度的甲基丙烯酸酯單體。由于選用的單體為液態(tài),避免了毒性有機(jī)溶劑的使用。同時(shí),選用了光引發(fā)劑819,在模擬自然光的照射下快速成膠,避免了高溫等嚴(yán)苛的條件。選用的單體對(duì)解脂耶式酵母具有優(yōu)異的生物相容性,制備過(guò)程對(duì)酵母溫和無(wú)害,包埋后酵母成活率最高可達(dá)到~96%。并且,包埋在有機(jī)膠中的酵母仍具有代謝活性,能夠生長(zhǎng)并發(fā)揮功能。
圖1 有機(jī)膠設(shè)計(jì)制備示意圖
圖3 (a)有機(jī)膠包埋解酯耶氏酵母凍存。(b)解酯耶氏酵母凍存存活率。
由不同單體制備得到的有機(jī)膠呈現(xiàn)出不同的相變性質(zhì),通過(guò)溫度的轉(zhuǎn)變,能夠快速且簡(jiǎn)便的在眾多有機(jī)膠中挑選出目的有機(jī)膠(圖4)。結(jié)合有機(jī)膠的多種優(yōu)異性質(zhì)及DNA信息存儲(chǔ)技術(shù),可以形成DNA數(shù)字信息的加密存儲(chǔ)的平臺(tái),進(jìn)行DNA數(shù)字信息傳遞及長(zhǎng)期儲(chǔ)存。
圖4 DNA數(shù)字信息的加密保存。
文章鏈接:https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jacs.2c00847
作者簡(jiǎn)介

張雷教授現(xiàn)任天津大學(xué)化工學(xué)院生物化工系教授,系主任,博士生導(dǎo)師,國(guó)家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年基金獲得者。主要研究方向包括生物化工與合成生物學(xué)、低溫保護(hù)、功能材料、海洋涂料等。在包括Nature Biotechnology, Nature Communications, JACS, Angew, AIChE Journal, CES, Research, Engineering等期刊發(fā)表論文100多篇。

肖文海,天津大學(xué)化工學(xué)院副教授,博士生導(dǎo)師。綠色生物制造重點(diǎn)專(zhuān)項(xiàng)“原料藥工業(yè)菌種改造關(guān)鍵技術(shù)及產(chǎn)業(yè)示范”項(xiàng)目課題負(fù)責(zé)人。主要研究方向是基于合成生物學(xué)技術(shù)和代謝工程技術(shù)高效構(gòu)建萜烯類(lèi)酵母細(xì)胞工廠,已在Biotechnology Advances, Metabolic Engineering,Microbial Cell Factories,Current Opinion in Biotechnology等國(guó)際知名刊物發(fā)表第一作者/通訊作者SCI論文30多篇,成果被Nature Chemistry,Nature Communications等高度評(píng)價(jià)。
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